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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Soja. |
Data corrente: |
18/06/2012 |
Data da última atualização: |
03/03/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
GUIMARÃES-DIAS, F.; NEVES-BORGES, A. C.; VIANA, A. A. B.; MESQUITA, R. O.; ROMANO, E.; GROSSI-DE-SÁ, M. de F.; NEPOMUCENO, A. L.; LOUREIRO, M. E.; ALVES-FERREIRA, M. |
Afiliação: |
FÁBIA GUIMARÃES DIAS, UFRJ; ANNA CRISTINA NEVES-BORGES, UNIRIO; ANTONIO AMERICO BARBOSA VIANA, CENARGEN; ROSILENE OLIVEIRA MESQUITA, UFV; EDUARDO ROMANO DE CAMPOS PINTO, CENARGEN; MARIA FATIMA GROSSI DE SA, CENARGEN; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, SRI; MARCELO EHLERS LOUREIRO, UFV; MÁRCIO ALVES-FERREIRA, UFRJ. |
Título: |
Expression analysis in response to drought stress in soybean: shedding light on the regulation of metabolic pathway genes. |
Ano de publicação: |
2012 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 222-232, May 2012. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Metabolomics analysis of wild type Arabidopsis thaliana plants, under control and drought stress conditions revealed several metabolic pathways that are induced under water deficit. The metabolic response to drought stress is also associated with ABA dependent and independent pathways, allowing a better understanding of the molecular mechanisms in this model plant. Through combining an in silico approach and gene expression analysis by quantitative real-time PCR, the present work aims at identifying genes of soybean metabolic pathways potentially associated with water deficit. Digital expression patterns of Arabidopsis genes, which were selected based on the basis of literature reports, were evaluated under drought stress condition by Genevestigator. Genes that showed strong induction under drought stress were selected and used as bait to identify orthologs in the soybean genome. This allowed us to select 354 genes of putative soybean orthologs of 79 Arabidopsis genes belonging to 38 distinct metabolic pathways. The expression pattern of the selected genes was verified in the subtractive libraries available in the GENOSOJA project. Subsequently, 13 genes from different metabolic pathways were selected for validation by qPCR experiments. The expression of six genes was validated in plants undergoing drought stress in both pot-based and hydroponic cultivation systems. The results suggest that the metabolic response to drought stress is conserved in Arabidopsis and soybean plants. MenosMetabolomics analysis of wild type Arabidopsis thaliana plants, under control and drought stress conditions revealed several metabolic pathways that are induced under water deficit. The metabolic response to drought stress is also associated with ABA dependent and independent pathways, allowing a better understanding of the molecular mechanisms in this model plant. Through combining an in silico approach and gene expression analysis by quantitative real-time PCR, the present work aims at identifying genes of soybean metabolic pathways potentially associated with water deficit. Digital expression patterns of Arabidopsis genes, which were selected based on the basis of literature reports, were evaluated under drought stress condition by Genevestigator. Genes that showed strong induction under drought stress were selected and used as bait to identify orthologs in the soybean genome. This allowed us to select 354 genes of putative soybean orthologs of 79 Arabidopsis genes belonging to 38 distinct metabolic pathways. The expression pattern of the selected genes was verified in the subtractive libraries available in the GENOSOJA project. Subsequently, 13 genes from different metabolic pathways were selected for validation by qPCR experiments. The expression of six genes was validated in plants undergoing drought stress in both pot-based and hydroponic cultivation systems. The results suggest that the metabolic response to drought stress is conserved in Arabidopsis and soybean plan... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Bioinformática; QPCR. |
Thesagro: |
Gene; Genoma; Resistência a seca; Soja. |
Thesaurus Nal: |
Biochemical pathways; Bioinformatics; Drought tolerance; Genes; Genome; Soybeans. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/61069/1/gmb.expression.anal.v35n1s.222-232.2012.pdf
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Marc: |
LEADER 02539naa a2200361 a 4500 001 1946634 005 2023-03-03 008 2012 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aGUIMARÃES-DIAS, F. 245 $aExpression analysis in response to drought stress in soybean$bshedding light on the regulation of metabolic pathway genes. 260 $c2012 520 $aMetabolomics analysis of wild type Arabidopsis thaliana plants, under control and drought stress conditions revealed several metabolic pathways that are induced under water deficit. The metabolic response to drought stress is also associated with ABA dependent and independent pathways, allowing a better understanding of the molecular mechanisms in this model plant. Through combining an in silico approach and gene expression analysis by quantitative real-time PCR, the present work aims at identifying genes of soybean metabolic pathways potentially associated with water deficit. Digital expression patterns of Arabidopsis genes, which were selected based on the basis of literature reports, were evaluated under drought stress condition by Genevestigator. Genes that showed strong induction under drought stress were selected and used as bait to identify orthologs in the soybean genome. This allowed us to select 354 genes of putative soybean orthologs of 79 Arabidopsis genes belonging to 38 distinct metabolic pathways. The expression pattern of the selected genes was verified in the subtractive libraries available in the GENOSOJA project. Subsequently, 13 genes from different metabolic pathways were selected for validation by qPCR experiments. The expression of six genes was validated in plants undergoing drought stress in both pot-based and hydroponic cultivation systems. The results suggest that the metabolic response to drought stress is conserved in Arabidopsis and soybean plants. 650 $aBiochemical pathways 650 $aBioinformatics 650 $aDrought tolerance 650 $aGenes 650 $aGenome 650 $aSoybeans 650 $aGene 650 $aGenoma 650 $aResistência a seca 650 $aSoja 653 $aBioinformática 653 $aQPCR 700 1 $aNEVES-BORGES, A. C. 700 1 $aVIANA, A. A. B. 700 1 $aMESQUITA, R. O. 700 1 $aROMANO, E. 700 1 $aGROSSI-DE-SÁ, M. de F. 700 1 $aNEPOMUCENO, A. L. 700 1 $aLOUREIRO, M. E. 700 1 $aALVES-FERREIRA, M. 773 $tGenetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto$gv. 35, n. 1, suppl., p. 222-232, May 2012.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Registros recuperados : 94 | |
61. | | MELEM JUNIOR, N. J.; CARNEIRO, C. E. A.; BRITO, O. R.; VENDRAME, P. R. S.; GUEDES, M. C.; COSTA, A. C. S. da; RICHART, A.; TREVISAN, A. T. Adsorção e fósforo remanescente em latossolo amarelo distrófico do cerrado do Amapá. In: SIMPÓSIO NACIONAL CERRADO, 9.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SAVANAS TROPICAIS, 2., 2008, Brasília, DF. Desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais: anais... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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62. | | BRITO, O. R; MELÉM JUNIOR, N. J.; FRANCHINI, J. C.; SILVA, A. P.; SOUZA, R. A.; BABUJIA, L. C.; GUEDES, M. C.; BRITO, R. M. Biomassa microbiana do solo cultivado com a sucessão milho - feijão - milho. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 1 CD-ROM. Organizado por: Adilson de Oliveira Júnior, Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, César de Castro, Fábio Álvares de Oliveira; Odilon Ferreira Saraiva.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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63. | | BRITO, O. R.; MELEM JUNIOR, N. J.; FRANCHINI, J. C.; SILVA, A. P.; SOUZA, R. A.; BABUJIA, L. C.; GUEDES, M. C.; BRITO, R. M. Biomassa microbiana do solo cultivado com a sucessão milho - feijão - milho. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. Desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: IAPAR: Universidade Estadual de Londrina, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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64. | | NOGUEIRA, M. A.; TELLES, T. S.; FAGOTTI, D. dos S. L.; BRITO, O. R.; PRETE, C. E. C.; GUIMARÃES, M. de F. Indicators of soil quality in the implantation of no-till system with winter crops. Revista Ciência Agronômica, Fortaleza, v. 45, n. 5, Esp., p. 990-998, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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65. | | BORIAN, T. B.; BRITO, O. R.; RICHART, A.; MELEM JUNIOR, N. J.; FEY, R.; FUJIMURA, A. M.; CAMOLEZZI, G. B.; TROMBINI, L. P.; SERCUNDES, R. K. Produção inicial de massa seca da Brachiaria brizantha Hochst Stapf em cinco solos do Estado do Paraná. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. Anais da FERTBIO 2006. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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66. | | DEMARCHI, D. E.; MELEM JUNIOR, N. J.; BRITO, O. R.; BAGATIN, A. K.; CAMOLEZZI, G. B.; BRITO, R. M.; AGUIAR, S. X. Produtividade do milho IPR 114 sob efeito de adubação orgânica e inorgânica. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. Desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: IAPAR: Universidade Estadual de Londrina, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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67. | | FUJIMURA, A. M.; RICHART, A.; BRITO, O. R.; CARNEIRO, C. E. A.; MELEM JUNIOR, N. J.; PISSINATI, D. S.; CUNHA, F. S.; CAMOLEZZI, G. B.; DEMARCHI, D. Teores de fósforo e zinco da matéria seca da parte aérea da Brachiaria brizanta cv. marandu cultivada em diferentes solos do Paraná. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Conquistas e desafios da Ciência do Solo brasileira. Porto Alegre: Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2007. 107 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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68. | | FELIX, J. C.; VENDRAME, P. R. S.; MARCHAO, R. L.; OLIVEIRA, J. F. de; GUIMARÃES, M. de F.; BROSSARD, M.; BECQUER, T.; BRITO, O. R. Predição de fósforo, carbono e nitrogênio em solos de basalto, por meio de espectroscopia NIR. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 9, p. 1405-1416, set. 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Unidades Centrais. |
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69. | | MELÉM JUNIOR, N. J.; CARNEIRO, C. E. A.; BRITO, O. R.; FRANCHINI, J. C.; GUEDES, M. C.; BRITO, R. M.; CUNHA, F. S. Proporção carbono labil/carbono total do solo após aplicação de resíduos orgânicos. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 1 CD-ROM. Organizado por: Adilson de Oliveira Júnior, Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, César de Castro, Fábio Álvares de Oliveira; Odilon Ferreira Saraiva. PDF. 588-2.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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70. | | MELEM JUNIOR, N. J.; CARNEIRO, C. E. A.; BRITO, O. R.; FRANCHINI, J. C.; GUEDES, M. C.; BRITO, R. M.; CUNHA, F. S. Proporção carbono lábil/carbono total do solo após aplicação de resíduos orgânicos. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. Desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: IAPAR: Universidade Estadual de Londrina, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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71. | | MELEM JUNIOR, N. J.; BRITO, O. R.; FONSECA JÚNIOR, N. da S.; FONSECA, I. C. de B.; AGUIAR, S. X. de. Nutrição mineral e produção de feijão em áreas manejadas com e sem queima de resíduos orgânicos e diferentes tipos de adubação. Semina. Ciências Agrárias, Londrina, v. 32, n. 1, p. 7-18, jan./mar. 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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72. | | BRITO, O. R.; OTSUBO, A. A.; MERCANTE, F. M.; HAYASHI, N. L. M.; OTSUBO, V. H. N.; PEREIRA, W. F.; SOUZA, D. C. de. Nitrogen fertilization and inoculation with Rhizobium tropici in black bean. Annual Report of the Bean Improvement Cooperative, v. 53, p. 172-173, mar. 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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73. | | OTSUBO, A. A.; SCHNITZER, J. A.; BRITO, O. R.; RAMOS, C.; GASPAR, G. G.; GONÇALVES, M. A.; OTSUBO, V. H. N. Matéria seca da parte aérea de Stylosanthes capitata em função de doses de fósforo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo; Fortaleza: UFC, 2009. 1 CD-ROM. Trabalho publicado também em Resumos do CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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74. | | FUJIMURA, A. M.; BRITO, O. R.; RICHART, A.; MELEM JUNIOR, N. J.; FEY, R.; CAMOLEZZI, G. B.; TROMBINI, L. P.; SERCUNDES, R. K.; BORIAN, T. B. Efeito de fontes de fósforo no estabelecimento da Brachiaria brizantha Hochst Stapf em cinco solos do Estado do Paraná. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. Anais da FERTBIO 2006. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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75. | | HAYASHI, F. Y. M.; MELEM JUNIOR, N. J.; BRITO, O. R.; FONSECA, N. S.; RICHART, A.; BAGATIN, A. K.; MARQUETTI JUNIOR, S. J. Fertilização orgânica e teores foliares de micronutrientes na cultura do feijão. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. Desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: IAPAR: Universidade Estadual de Londrina, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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76. | | RICHART, A.; BRITO, O. R.; CARNEIRO, C. E. A.; MELEM JUNIOR, N. J.; FUJIMURA, A. M.; PISSINATI, D. S.; CUNHA, F. S.; CAMOLEZZI, G. B. Extratores para avaliação da disponibilidade de fósforo em solos arenosos adubados com fosfato natural reativo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Conquistas e desafios da Ciência do Solo brasileira. Porto Alegre: Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2007. 317Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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77. | | RICHART, A.; BRITO, O. R.; ALVES, S. J.; CARNEIRO, C. E. A.; MELEM JUNIOR, N. J.; FUJIMURA, A. M.; PISSINATI, D. S.; CUNHA, F. S.; CAMOLEZZI, G. B. Extratores para avaliação da disponibilidade de fósforo em solos argilosos adubados com fosfato natural reativo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Conquistas e desafios da Ciência do Solo brasileira. Porto Alegre: Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2007. p. 113.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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78. | | BRITO, O. R.; OTSUBO, A. A.; ZUFFO, N. L.; FARIA, L. C. de; OTSUBO, V. H. N.; MERCANTE, F. M.; BRITO, R. M. Evaluation of carioca bean lines in a savannah area of Brazil. Annual Report of the Bean Improvement Cooperative, v. 52, p. 148-149, March 2009.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Arroz e Feijão. |
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79. | | PISSINATI, D. S.; RICHART, A.; BRITO, O. R.; ALVES, S. J.; CARNEIRO, C. E. A.; MELEM JUNIOR, N. J.; FUJIMURA, A. M.; CUNHA, F. S. Estabelecimento da Brachiaria brizanta Hochest Stapf cv marandu sob diferentes fontes e doses de fósforo em solos do Paraná. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Conquistas e desafios da Ciência do Solo brasileira. Porto Alegre: Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2007. p. 111.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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80. | | CANIZELLA, B. T.; VENDRAME, P. R. S.; MARQUEZIN, P. P.; FELIX, J. C.; BRITO, O. R.; ABADE, V. S.; MARCHAO, R. L. Espectrometria de infravermelho próximo na predição da textura de solos desenvolvidos de basalto. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE LA CIENCIA DEL SUELO, 20.; CONGRESO PERUANO DE LA CIENCIA DEL SUELO, 16., 2014, Cusco. Educar para preservar el suelo y conservar la vida en la tierra. Cusco: Centro de Convenciones de la Municipalidad del Cusco, 2014. 1 Pendrive.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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